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莓叶委陵菜叶绿体基因组特征及其系统发育分析

作  者:
郭松;梁湘兰;彭姿;卢全;曾珍贵
单  位:
广西科技师范学院生物与食品工程学院;广西科技师范学院智慧农业学院(物联网工程学院)
关键词:
莓叶委陵菜;叶绿体基因组;系统发育;瑶药
摘  要:
为解析莓叶委陵菜叶绿体基因组特征,探究其在蔷薇科物种中的发育关系,本研究通过莓叶委陵菜叶绿体基因组的测序、组装、注释以及结合生物信息方法获得其叶绿体全基因组特征信息,并构建了系统发育进化树。结果表明,莓叶委陵菜叶绿体基因组全长156 844 bp,为一个典型的四分体结构,GC含量GC321,密码子偏好以A/T结尾,IR边界分析表明,其基因组结构较为保守。通过与蔷薇科下草莓属、蔷薇属、委陵菜属的13个物种进行系统发育分析,得到莓叶委陵菜与蛇莓的亲缘关系较近,以100%自举值聚到一起。本研究将有助于莓叶委陵菜的系统发育和遗传研究。

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