中国农业科学院农业信息研究所 中国农学会
Agricultural Information Institute of CAAS China Association of Agricultural Science Societies
En
Ch
中国农业科学院农业信息研究所 中国农学会 主办

AI检索

订阅

返回顶部
当前位置: 首页 > 文章 > 大白菜KASP反应体系的优化与建立 园艺学报 2018 (12) 2442-2452
Position: Home > Articles > Optimization and Establishment of KASP Reaction System for Chinese Cabbage(Brassica rapa L. ssp. pekinensis) Acta Horticulturae Sinica 2018 (12) 2442-2452

大白菜KASP反应体系的优化与建立

作  者：
杨双娟;原玉香;魏小春;王志勇;赵艳艳;姚秋菊;张晓伟
单  位：
河南省农业科学院园艺研究所
关键词：
大白菜;KASP;反应体系优化
摘  要：
以大白菜基因组DNA为模板,对影响竞争性等位基因特异性PCR(Kompetitive allele specific PCR,KASP)的反应体积、引物浓度和DNA模板用量等3个参数进行优化,建立了适用于大白菜的KASP反应体系。96孔模块最佳反应体系中,总反应体积为8μL,其中模板DNA(60～80 ng·μL~(-1))1μL,KASP Master mix(2×)4μL,引物混合物(50μmol·L~(-1))0.14μL,ddH_2O 3μL。384孔模块最佳反应体系中,总反应体积为4μL,其中模板DNA(60～80 ng·μL~(-1))1μL,KASP Master mix(2×)2μL,引物混合物(50μmol·L~(-1))0.07μL,ddH_2O 1μL。利用不同引物和不同的大白菜材料对优化的反应体系进行验证,均获得了较好的KASP-SNP分型,验证了该优化体系的稳定性。该反应体系可以用于大白菜遗传多样性研究、基因定位、遗传图谱构建等遗传学研究。
译  名：
Optimization and Establishment of KASP Reaction System for Chinese Cabbage(Brassica rapa L. ssp. pekinensis)
作  者：
YANG Shuangjuan;YUAN Yuxiang;WEI Xiaochun;WANG Zhiyong;ZHAO Yanyan;YAO Qiuju;ZHANG Xiaowei;Institute of Horticulture,Henan Academy of Agricultural Sciences;
单  位：
YANG Shuangjuan%YUAN Yuxiang%WEI Xiaochun%WANG Zhiyong%ZHAO Yanyan%YAO Qiuju%ZHANG Xiaowei%Institute of Horticulture,Henan Academy of Agricultural Sciences
关键词：
Chinese cabbage;;KASP;;reaction system optimization
摘  要：
In this study,the KASP(Kompetitive allele specific PCR)reaction system suitable for Chinese cabbage(Brassica rapa L. ssp. pekinensis)was established through optimization of three parameters(reaction volume,primer concentration and template DNA amount),which used genomic DNA from Chinese cabbage as template. The optimal KASP reaction system for 96-well plate format was as follows:total volume 8 μL,containing 1 μL template DNA(60–80 ng · μL~(-1)),4 μL KASP Master mix(2×),0.14 μL primer assay mix(50 μmol · L~(-1))and 3 μL ddH_2O. The optimal KASP reaction system for 384-well plate format was as follows:total volume 4 μL,containing 1 μL template DNA(60–80 ng · μL~(-1)),2 μL KASP Master mix(2×),0.07 μL primer assay mix(50 μmol · L~(-1))and 1 μL ddH_2O. With the optimal KASP reaction system,high quality results of KASP-SNP genotyping were produced on different Chinese cabbage accessions with different primers,which indicated the stability of the current system. The optimized KASP reaction system can be used in genetic study for Chinese cabbage,such as genetic diversity analysis,gene mapping and genetic map construction.

相似文章

导出引用
计量
文章访问数: 15
HTML全文浏览量: 0
PDF下载量: 0

所属期刊

推荐期刊

友情链接Friendly link
农业信息研究所Agricultural information institute 农业智能知识服务平台Agricultural intelligent knowledge service platform 农业学术服务平台Agricultural Knowledge Service System 中国知网CNKI 维普网VIP 万方WANFANG DATA
联系我们Contact us

电话Tell：010-82109652-808

邮箱E-mail：agrijournal@caas.cn

服务Service
关于我们About us 意见建议Opinions and suggest
版权说明Copyright
单位：中国农业科学院农业信息研究所 中国农学会 © 2017中国农业科学院农业信息研究所 ICP备案号：京ICP备09089781号-46