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当前位置: 首页 > 文章 > 草鱼呼肠孤病毒096 vp4基因生物信息学分析及其在肾细胞中的表达 广东海洋大学学报 2015 (4) 56-62
Position: Home > Articles > Bioinformatics Analysis of the vp4 Gene in GCRV 096 and Its Expression in Ctenopharyngodon idellus Kidney Cells Journal of Guangdong Ocean University 2015 (4) 56-62

草鱼呼肠孤病毒096 vp4基因生物信息学分析及其在肾细胞中的表达

作  者：
闫秀英;郭定利;郑树城;王雅;谢吉国;简纪常;吴灶和
单  位：
上海海洋大学水产与生命学院;北京市大兴区水产技术推广站;广东海洋大学水产学院;广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室暨水产经济动物病害控制广东普通高校重点实验室
关键词：
草鱼呼肠孤病毒;vp4基因;生物信息学;真核表达
摘  要：
克隆得一株新分离病毒草鱼呼肠孤病毒(GCRV)096的长为1 981 bp的vp4基因,分析该基因的生物信息及其编码蛋白的特性。生物信息学分析表明,同一基因型GCRV分离株vp4基因间的差异不大,但不同基因型GCRV分离株vp4基因间却存在很大的差异。GCRV 096 VP4蛋白含有多个功能位点、2个跨膜结构域及多个潜在的抗原决定簇。构建p EGFP-N3-VP4真核表达质粒,并转染至草鱼肾(Ctenopharyngodon idellus kidney,CIK)细胞中,经荧光显微镜观察和Western blot鉴定,表明GCRV 096 VP4融合蛋白在CIK细胞中得以成功表达。
译  名：
Bioinformatics Analysis of the vp4 Gene in GCRV 096 and Its Expression in Ctenopharyngodon idellus Kidney Cells
作  者：
YAN Xiu-ying;GUO Ding-li;ZHENG Shu-cheng;WANG Ya;XIE Ji-guo;JIAN Ji-chang;WU Zao-he;Fisheries College of Guangdong Ocean University, Guangdong Ocean University;Guangdong Key Laboratory of Pathogenic Biology and Epidemiology for Aquatic Economic Animals, and Key Laboratory of Control for Diseases of Aquatic Economic Animals of Guangdong Higher Education Institutes;College of Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University;Beijing’s Daxing District Aquatic Product Technology Promotion Department;
关键词：
grass carp reovirus strain 096(GCRV 096);;the vp4 gene;;bioinformatics;;eukaryotic expression
摘  要：
GCRV 096 is a new grass carp reovirus strain. The vp4 gene 1 981 bp in length in GCRV 096 is cloned, and the characteristics of the vp4 genes and the VP4 proteins in GCRVs are analyzed. Results of bioinformatics analysis show that there is little difference between the vp4 genes in GCRV strains attributed to the same genotype, but the difference between vp4 genes in GCRV strains attributed to different genotypes is much more. The VP4 protein contains multiple functional sites, two transmembrane domain and many potential antigenic eukaryotic determinants. Furthermore, the expression plasmid p EGFP-N3-VP4 of the vp4 gene in GCRV 096 is constructed and transformed into Ctenopharyngodon idellus kidney(CIK) cells. Fluorescence microscope and western blot results indicate that the VP4 fusion protein is successfully expressed in CIK cells.

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