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基于高通量测序技术分析笼养熊猴肠道细菌菌群多样性

作  者:
木仁;杨秉山;楠田哲仕;格根图雅;吴艳梅;陈春春;岑光娇;徐文斌
单  位:
岐阜大学应用生物科学部;黔南民族师范学院生物科学与农学院;宁波大学海洋学院;黔南民族师范学院图书馆;贵州省都匀市西山公园
关键词:
熊猴;肠道菌群;高通量测序;16S rRNA;厚壁菌门
摘  要:
为了明确熊猴(Macaca assamensis)肠道菌群的组成,试验采用高通量测序技术对2只成年(雌雄各1只)和2只少年(雄性)笼养熊猴粪便中的细菌16S rRNA基因V3和V4区域扩增子进行分析.结果表明:本试验共获得460种OTUs聚类信息,每个样品平均(395.00±8.54)个.共注释到15个门,平均相对丰度高于1%的有4个,分别为厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门和螺旋体门,丰度分别为(61.66±8.47)%、(31.84±7.23)%、(3.16±1.09)%和(1.73±0.50)%.共注释到115个属,平均相对丰度高于1%的属有19个,其中占比最高的是乳酸杆菌属,其次为理研菌科RC9菌属和普雷沃菌属9,丰度分别为(14.61±3.17)%、(11.68±3.49)%和(8.69±1.03)%.笼养熊猴肠道菌群在少年雄性与成年雄性个体间差异较小,性别间差异相对较大.肠道微生物组成在门水平上与其他猕猴属基本一致,但在属水平上有较大差异.

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