甘薯、番茄、拟南芥中SPL转录因子的生物信息学分析
作 者：
荣誉磊;周志林;赵冬兰;唐君;彭湘君;赵玉琪;宗凯;吕亚宁;姚改芳;胡康棣;张华
单 位：
江苏徐淮地区徐州农业科学研究所;合肥海关技术中心;合肥工业大学食品与生物工程学院
关键词：
SPL转录因子家族;番茄;甘薯;拟南芥;生物信息学;
摘 要：
对甘薯、番茄、拟南芥中63个SPL基因家族进行了系统进化树分析、保守蛋白基序（Motif）分析,筛选归纳出同源性较高的2个分支的12个SPL基因进行理化性质分析、核定位预测等,氨基酸序列比对结果表明这些基因的功能可能较为保守。通过对番茄中的SPL基因Solyc05g015510.2、Solyc10g078700.1进行表达量分析,发现这2个基因可能参与调控果实成熟衰老进程。另外,通过对非生物胁迫下的转录水平进行分析得知,拟南芥中的AT5G43270可能参与对盐胁迫、热胁迫条件下的响应,AT1G27360、AT1G27370可能参与热胁迫条件下的响应,AT2G42200可能参与冷胁迫条件下的响应,而AT3G57920在非生物胁迫条件下表达量没有特别明显的变化,表明AT3G57920可能不参与非生物胁迫下的响应。
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