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望春玉兰WRKY基因家族生物信息学分析

作  者:
戴晓港;刘景胜;李淑娴
单  位:
南京林业大学林学院/南方杨树工程技术研究中心/江苏省杨树种质创新与品种改良重点实验室
关键词:
望春玉兰;WRKY转录因子;进化分析;基因表达模式;
摘  要:
WRKY超级转录因子基因家族,参与植物生长、发育、非生物胁迫以及次生代谢产物的调节。该文鉴定了药用植物望春玉兰全基因组WRKY基因,并采用生物信息学方法,分析了该基因家族成员的蛋白理化性质、亚细胞定位、系统进化、保守结构域、顺式作用元件,以及在不同组织中的表达模式。在望春玉兰全基因组中共鉴定56个WRKY基因;根据进化分析的结果,将这些基因分为3个组(GroupⅠ—Ⅲ),又将GroupⅡ进一步分为5个亚组(Ⅱa—Ⅱe)。该家族基因蛋白分子量在12 215.15—191 326.88 Da之间,理论等电点在4.9—10.06之间。亚细胞定位结果显示,55个基因家族成员定位在细胞核,其中1个基因同时定位在细胞外间隙,还有1个基因定位在细胞质。顺式作用元件分析表明,望春玉兰WRKY基因除了广泛参与到调节非生物胁迫中,还参与次生代谢产物的合成调控。该文同时分析了WRKY基因在根、叶片和花中的表达模式,并鉴定了组织特异表达基因。通过对望春玉兰WRKY基因家族的生物信息学分析,为深入研究WRKY基因家族的功能提供了基础。

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