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山羊地方性鼻内肿瘤病毒安徽株全基因组序列分析

作  者:
李翎旭;王珍;郭文晴;林子彦;常广军;姚大伟
单  位:
南京农业大学动物医学院
关键词:
山羊;地方性鼻内肿瘤病毒;地方性鼻内腺癌;全基因组序列
摘  要:
获得安徽地区2株山羊地方性鼻内肿瘤病毒(enzootic nasal tumor virus-2,ENTV-2)全基因组序列,分析ENTV-2基因的遗传多样性。采集安徽某羊场6只患地方性鼻内腺癌(enzootic nasal adenocarcinoma, ENA)的山羊鼻腔分泌物和血液样品,采用Trizol法提取总RNA,去除其中DNA干扰完成两步法反转录,PCR检测病料中的ENTV-2。选择其中2只山羊的阳性样品,采用5对引物扩增ENTV-2全基因组序列,测序拼接后上传NCBI数据库,与数据库中序列进行比较分析并构建遗传进化树。本研究在6只病羊鼻腔分泌物样品中均可检测出ENTV-2,而血液中不能检出。ENTV-2基因全长约7 400 bp,分别命名为ENTV-2AH1(DDBJ登录号:LC762616)和ENTV-2AH2(DDBJ登录号:LC762617),序列分析显示与国内福建株(ENTV-2FJ)、广西株(ENTV-2-DA0)同源性分别为99.2%、99.1%,并且处于同一进化分支。本研究首次在安徽地区检测到山羊地方性鼻内肿瘤病毒,获得了ENTV-2全基因组序列,有助于进一步研究国内ENTV-2遗传多样性。

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