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基于转录组鉴定楸子叶片和根系干旱响应基因

作  者:
王顺才;李超;马锋旺;王弋博
单  位:
旱区作物逆境生物学国家重点实验室;天水师范学院甘肃省农业固体废弃物资源化利用重点实验室
关键词:
苹果砧木;干旱胁迫;叶片和根系;转录组;差异表达基因;
摘  要:
利用RNA-Seq技术研究楸子根、叶组织响应干旱胁迫的差异表达基因(DEGs),为探讨苹果砧木不同组织的抗旱分子机制提供理论依据。结果表明,与对照相比,在干旱胁迫下根、叶组织的基因表达数被抑制。叶片得到2 211个DEGs,其中1 128个上调,1 083个下调;根系得到4 996个DEGs,其中1 810个上调,3 186个下调。叶片DEGs显著富集于植物激素信号转导、淀粉和蔗糖代谢、氨基酸和核苷酸糖代谢以及半乳糖代谢等通路,叶片重要功能基因与ABA胁迫响应、IAA内稳态、肌醇和棉子糖合成关键酶、硝酸根转运蛋白、伸展蛋白、铁蛋白和脱水蛋白等相关。根系DEGs显著富集于苯丙烷类生物合成、植物病原菌互作、苯丙氨酸代谢、谷胱甘肽代谢以及萜类(双萜,倍半萜和三萜)生物合成等通路,重要表达基因与木质素、类胡萝卜和萜类次生代谢物、环核苷酸门控离子通道、钙离子和MAPK信号途径等相关。这些干旱响应基因在抗旱反应中可能对维持根、叶组织特异功能起到重要的作用。

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