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Position: Home > Articles > Transcriptome analysis of soybean roots in response to early iron deficiency stress Journal of Nanjing Agricultural University 2022,45 (2) 224-234

大豆根系响应早期缺铁胁迫的转录组分析

作  者:
王婷婷;陈鸽;包悦琳;金东淳
单  位:
延边大学农学院
关键词:
大豆;缺铁胁迫;早期;转录组;差异表达基因
摘  要:
[目的]本文旨在探明2个大豆品种根系对早期缺铁胁迫的响应差异.[方法]以铁高效品种'吉育99'和铁低效品种'吉育93'大豆为材料进行水培试验,将对照(25μmol?L-1 Fe)和早期(1和6 h)缺铁胁迫(1μmol?L-1 Fe)处理的大豆根系进行转录组测序.[结果]与对照相比,铁高效大豆品种差异基因数随着缺铁胁迫时间的延长而增加,而铁低效品种差异基因数随着胁迫时间的延长而降低.差异表达基因(differential expression gene,DEG)的KEGG通路富集结果表明,缺铁胁迫处理1 h,2个大豆品种在苯丙烷生物合成、倍半萜和三萜生物合成、植物病原体相互作用、植物MAPK信号通路、淀粉和蔗糖代谢等代谢通路中的相关基因表达有显著差异.缺铁胁迫处理6 h,2个大豆品种在苯丙烷生物合成、倍半萜和三萜生物合成、类黄酮生物合成、谷胱甘肽代谢等代谢通路中的相关基因表达有显著差异.差异表达基因转录因子分析结果表明,铁高效大豆品种受早期缺铁胁迫调控的转录因子家族主要有AP2/ERF-ERF、C2H2、MYB、WRKY、bHLH、NAC,铁低效大豆品种中转录因子家族主要有AP2/ERF-ERF、MYB、WRKY、bHLH、NAC.[结论]缺铁胁迫1 h大豆就能对缺铁胁迫作出响应,且不同铁效率大豆品种在苯丙烷生物合成、转录因子调控等相关基因的表达存在显著差异.
译  名:
Transcriptome analysis of soybean roots in response to early iron deficiency stress

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