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基于数据挖掘、网络药理学和分子对接探究中医药治疗房颤的核心中药及机制

作  者:
邓良英;孙园园;高磊;王炜;石开虎
单  位:
关键词:
房颤;中药;数据挖掘;网络药理学;分子对接;用药规律;丹参;苦参
摘  要:
本研究主要挖掘数据,分析中药治疗房颤的用药规律,并通过网络药理学、分子对接及分子动力学方法探究其核心药对机制.检索知网、维普等数据库的中医药治疗房颤的临床资料,运用SPSS Modeler 18.0进行关联规则分析房颤用药规律;通过TCMSP数据库、OMIM和DrugBank等数据库分析核心药对的活性成分及潜在靶点,构建房颤靶点-活性成分-药物网络;通过String数据库得到房颤核心靶点PPI网络,以及使用Metascape进行GO生物功能分析和KEGG通路分析;对关键成分与关键靶点进行分子对接验证,最后进行分子动力学模拟.结果显示:治疗房颤用药频率前五分别是丹参、炙甘草、麦冬、桂枝和当归,高频药对有"丹参-苦参"、"麦冬-五味子"等.对"丹参-苦参"核心药分析发现其通过槲皮素、木犀草素和丹参酮ⅡA等关键成分作用于房颤AKT1、TNF、IL-6、VEGFA、IL-1β和CASP3核心靶点,参与NF-κB信号通路、cGMP-PKG信号通路和AMPK等通路.分子对接显示,槲皮素、木犀草素、丹参酮ⅡA与AKT1、CASP3、IL-1β等靶点紧密结合,AKT1-丹参酮ⅡA为结合亲和力最高的复合物,分子动力学模拟发现,蛋白-配体构象在40 ns形成稳定构象,并在活性位点形成了氢键.治疗房颤中药主要有丹参、麦冬和桂枝等,关键成分丹参酮ⅡA可能通过调控AKT1等关键靶点治疗房颤,参与NF-κB信号通路、cGMP-PKG信号通路和AMPK等通路,并在调控离子通道和影响炎症因子释放等方面发挥治疗房颤的作用.
译  名:
The Core Traditional Chinese Medicines and Mechanism of Traditional Chinese Medicine Treatment of Atrial Fibrillation Based on Data Mining,Network Pharmacology and Molecular Docking
关键词:
atrial fibrillation%traditional Chinese medicine%data mining%network pharmacology%molecular docking%medication rules%Ra-dix Salvia%Sophorae Flavescentis Radix

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