当前位置: 首页 > 文章 > 甘蔗割手密种PIN基因家族的鉴定与表达分析 分子植物育种 2021 (19) 6338-6347
Position: Home > Articles > 甘蔗割手密种PIN基因家族的鉴定与表达分析 Molecular Plant Breeding 2021 (19) 6338-6347

甘蔗割手密种PIN基因家族的鉴定与表达分析

作  者:
黄宁;方振名;李琳;阙友雄;朱宇林;邓旭;凌辉
单  位:
福建农林大学国家甘蔗工程技术研究中心;玉林师范学院生物与制药学院
关键词:
甘蔗;割手密;PIN;生物信息学;基因家族;
摘  要:
PIN (PIN-FORMED)作为生长素输出载体,在生长素极性运输过程中起重要作用,但是目前在甘蔗中还没有相关研究。本研究结合甘蔗割手密种基因组数据、非生物胁迫和生物胁迫下的甘蔗栽培种转录组数据,通过生物信息学分析技术,对甘蔗割手密种PIN基因进行了基因家族鉴定、基因结构及功能分析。分析结果表明,甘蔗割手密种中共有22个SsPIN基因,其中包括15对串联重复基因,启动子包含16类顺式元件,外显子和内含子数目差别明显,分布于14条染色体。SsPINs氨基酸长度在305~791之间,其编码蛋白质分子量在33.20~84.62 kD之间,跨膜结构数目在4~17之间,具有保守基序2,绝大多数属于稳定的碱性蛋白。SsPIN基因家族成员响应低氮、高粱花叶病毒和黑穗病菌胁迫,推测生长素和非生物胁迫及生物胁迫信号通路间存在交叉。本研究为揭示PIN基因在甘蔗逆境适应中的生物学作用奠定了基础,为未来抗性品种开发和选择提供依据。

相似文章

计量
文章访问数: 9
HTML全文浏览量: 0
PDF下载量: 0

所属期刊

推荐期刊