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山药块茎发育阶段基因共表达网络构建及阶段特异性分析

作  者:
殷剑美;张铅;蒋璐;张培通
单  位:
江苏省农业科学院经济作物研究所
关键词:
山药;转录组测序;阶段特异性基因;基因共表达网络
摘  要:
山药是一种药食同源作物,块茎是其主要产品器官,其发育机制对于山药产量和品质提升相关育种有着重要的指导作用.以不同生长阶段(块茎膨大第1 d、第11 d、第21 d、第31 d、第41 d、第51 d,T1~T6)的山药块茎为材料进行转录组测序,经从头(de novo)组装后获得42042个unigenes,利用七大数据库进行注释,鉴定后发现山药块茎形成过程中涉及大量基因,包括激素合成、信号转导等相关基因.阶段特异性分析结果表明,块茎形成初始阶段为块茎发育的关键时期;加权基因共表达网络分析结果表明,在山药块茎形成初期及后期,激素相关基因的表达特别活跃,脱落酸(ABA)、茉莉酸(JA)是山药块茎生长发育的重要激素.研究结果为进一步研究山药块茎膨大分子机制奠定了基础.
译  名:
Stage-specific and weighted gene co-expression network analyses of yam ( Dioscorea alata L. ) tuber growth

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