Position: Home > Articles > 巨菌草内生固氮菌Klebsiella variicola GN02 nifH基因的克隆及生物信息学分析
Hubei Agricultural Sciences
2020
(3)
147-153
巨菌草内生固氮菌Klebsiella variicola GN02 nifH基因的克隆及生物信息学分析
作 者：
林标声;张浣星;何玉琴;罗茂春;林占熺
单 位：
龙岩学院生命科学学院
关键词：
巨菌草(Pennisetum giganteum);内生固氮菌;Klebsiella variicola;nifH基因;克隆;生物信息学
摘 要：
研究巨菌草(Pennisetum giganteum)内生固氮菌Klebsiella variicola GN02 nifH基因的生物学信息,对GN02菌株nifH基因进行克隆及完整性验证,并采用多种生物学在线软件对其进行生物信息学预测和分析.结果表明,GN02菌株nifH基因具有完整的ORF,长度882 bp,编码293个氨基酸,NCBI GenBank登录号为MK131264.生物信息学分析表明,GN02菌株nifH基因具有高度保守性,与其他物种来源的nifH基因核苷酸序列及氨基酸序列同源性均达到95%以上.nifH蛋白总相对分子量为31 970.73、理论等电点pI为4.72;跨膜模型倾向N-末端向外的由内到外的跨膜、整个多肽链表现为亲水性;有2个糖基化位点但无分泌信号肽,有可能存在螺旋卷曲结构;二级结构预测表明α-螺旋和无规则卷曲是其多肽链中的主要结构元件,延伸链散布于整个蛋白质中;在数据库中能对该蛋白进行三维同源建模.
导出引用
计量
文章访问数: 7
HTML全文浏览量: 0
PDF下载量: 0
所属期刊
