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海蓬子DnaJ-like基因片段的表达和生物信息学分析

作者：

张大栋;周春霖;任丽娟;王茂文;汤日圣;马鸿翔

单位：

江苏省沿海地区农业科学研究所;江苏省农业科学院农业生物遗传生理研究所

关键词：

DnaJ-like基因;表达;生物信息学分析;海蓬子

摘要：

从盐生植物海蓬子的抑制消减杂交文库中克隆了DnaJ-like基因的长609 bp的DNA序列,编码1个202 aa的开放阅读框,Northern B loting显示该基因在检测子(200 mmol/L NaC l)中的表达显著增强。生物信息学分析表明,在蛋白质水平上,该片段与拟南芥和水稻的同源性分别为6 e-68和1 e-58;在核酸水平上,该片段与拟南芥的同源性为3 e-24。保守区分析显示,该片段含有DnaJ-like基因完整的J功能域(J-Dom ain,66 aa),功能域在蛋白质水平与GenBank两种相关类型的J功能域的同源性分别为1 e-11和9 e-15。这为该基因的克隆及研究其在植物逆境胁迫中的作用奠定了基础。

译名：

Expression and Bioinformatics Analysis of DnaJ-like Gene Sequence from Salicornia bigelovii Torr.

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海莲子DnaJ-like基因片段的表达和生物信息学分析 [张大栋, 周春霖, 任丽娟, 王茂文, 汤日圣, 马鸿翔] 江苏农业学报 2006,022 (3) 222-224

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