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皱皮香猪3个基因组拷贝数变异的多态性分布

作者：

王州;冉雪琴;牛熙;李升;黄世会;王嘉福

单位：

贵州大学动物科学学院山地植物资源保护与保护种质创新教育部重点实验室

关键词：

皱皮香猪;拷贝数变异;多态性;皮肤;剂量效应

摘要：

为探究皱皮香猪个体产生皮肤变异的根本原因,本文基于重测序数据,采用生物信息学分析皱皮香猪基因组中的拷贝数变异(CNV),通过荧光定量PCR方法检测皱皮香猪中3个CNVs的拷贝数变异规律,并与香猪和大白猪进行比较.结果表明:3个CNVs在猪群中的拷贝数变异呈现出多态性变化,皱皮香猪中CNV1以拷贝数缺失型为主,其中的MPC1和RSK3基因可能与脂肪沉积有关;皱皮香猪CNV2和CNV3以拷贝数增加型占优势,其中的CCL17和CX3CL1基因参与皮肤等组织的炎症反应,可能通过剂量效应引起香猪皮肤产生褶皱.

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