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Position: Home > Articles > Bioinformatics Analysis of Squalene Synthase Coding Gene and Amino Acid Sequence in Panax ginseng Genus Chinese Agricultural Science Bulletin 2012,28 (31) 220-226

人参属植物鲨烯合酶编码基因及其氨基酸序列的生物信息学分析

作  者:
毛乐心;赵昶灵;支伟特;陈文龙;陈中坚;缪康汝
单  位:
文山县苗乡三七实业有限公司;云南农业大学农学与生物技术学院
关键词:
人参属;鲨烯合酶;生物信息学分析
摘  要:
利用生物信息学方法对GenBank中人参属9种植物鲨烯合酶的cDNA序列以及其编码的氨基酸序列的结构、理化性质、信号肽、疏水性、亲水性、亚细胞定位、跨膜结构域功能域和进化关系进行了初步预测和分析。结果表明:总体上人参属鲨烯合酶核苷酸序列相似性平均为96.245%,氨基酸相似性平均为95.5%。其二级结构预测结果显示9个鲨烯合酶氨基酸序列以α螺旋和无规则卷曲为主要组成部分。对9种人参属植物进行进化树分析发现可以分为2个亚族。对包括人参属9种植物在内的其他物种进行进化树分析可知,植物、动物、酵母分属不同的类群。通过分析人参属植物鲨烯合酶及其编码基因的生物信息学特征,可以为鲨烯合酶基因的克隆和遗传操作提供理论参考。
译  名:
Bioinformatics Analysis of Squalene Synthase Coding Gene and Amino Acid Sequence in Panax ginseng Genus

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