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Position: Home > Articles > Detection of the causal agent of strawberry Fusarium wilt by loop-mediated isothermal amplification Journal of China Agricultural University 2022,27 (3) 172-180

基于环介导等温扩增技术的草莓枯萎病检测

作  者:
侯圣凡;刘峻杰;李小峰;王红清
单  位:
中国农业大学农学与生物技术学院
关键词:
草莓;草莓枯萎病;F.oxysporum f.sp.fragariae;环介导等温扩增技术;聚合酶链式反应
摘  要:
为快速鉴定Fusariumoxysporum f.sp.fragariae(Fof)引起的草莓枯萎病,主要采用环介导等温扩增技术(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)建立了 Fof的快速检测体系,使用组织分离法和PCR法对LAMP 技术辅佐验证.结果表明:25 μL 体系中添加 Buffer 2.50 μL、Mg2+(100 mmol/L)0.25 μL、dNTPs(10 mmol/L)1.00 μL、FIP 和 BIP(20 μmol/L)各 1.00 μL、F3和 B3(10 μmol/L)各0.50μL、LoopF(10 μmol/L)0.75 μL、Bst DNA 聚合酶(8 U/μL)0.50 μL、Betaine(5 mol/L)1.00 μL、DNA 模板 1.00 μL 和 ddH2O 15.00 μL,反应结束后添加0.40 μL的SYBR Green I染料为最佳反应体系;该体系最适反应温度为62.9℃,最佳反应时间为60 min;特异性试验表明该体系能从16种草莓常见病原菌中特异性检测出Fof,最低检出限为45 pg/μL,比常规PCR检测效率高;随机抽取田间病害样品16株,采用LAMP体系检测罹病草莓根茎中的病原菌,其中12株感病草莓的病原菌为Fof,使用组织分离法和PCR法验证了 LAMP检测结果的准确性;传统病原菌鉴定耗时约5~7 d,而LAMP检测1 d内便可完成.综上,本研究建立的LAMP检测体系为Fof准确快速检测及实际应用奠定了基础.
译  名:
Detection of the causal agent of strawberry Fusarium wilt by loop-mediated isothermal amplification

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