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黄连根腐病发生与根际土壤、根茎内生、叶内生细菌群落结构变化关系

作  者:
唐涛;袁斌;王帆帆;郭杰;郭晓亮;段媛媛;游景茂
单  位:
湖北省农业科学院植保土肥研究所;湖北省农业科学院中药材研究所
关键词:
黄连;根腐病;细菌群落结构;高通量测序;多样性
摘  要:
为了探讨细菌群落结构与黄连根腐病发生的关系,本文分析了两个不同地点健康和染病黄连的根茎、叶内生细菌和根际土壤细菌的组成和差异。结果显示,黄连根茎、叶片和根际土壤样品中根际土壤细菌群落多样性最丰富,根茎内生菌次之。在所有样品中,主要的优势菌门为变形菌门Proteobacteria、放线菌门Actinobacteria、拟杆菌门Bacteroidetes和绿弯菌门Chloroflexi。相较于健康黄连组样品,染病黄连根际土壤、根茎和叶片样品中多个菌属细菌相对丰度发生显著改变,如Vibrionimonas,乳杆菌属Lactobacillus和鞘氨醇单胞菌属Sphingomonas等,表明可能与黄连根腐病的发生有一定关联。此外,RDA分析表明,伯克氏菌属Burkholderia、全噬菌属Holophaga和雷尔氏菌属Ralstonia与黄连根际土壤有机质、有效氮、pH有显著相关性。本研究分析了两个不同地点的健康和染病黄连根际、叶片内生细菌和根际土壤细菌群落结构差异,为综合分析黄连根腐病的成因和机制提供了参考。
译  名:
Relationships between the occurrence of root-rot and the change in the community structure of rhizosphere soil bacteria, rhizome and leaf endophytic bacteria of Coptis chinensis

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