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Position: Home > Articles > Development and application of a real-time PCR method for detection of west African strain of Sweet potato chlorotic stunt virus Acta Phytopathologica Sinica 2014,44 (5) 461-468

甘薯褪绿矮化病毒西非株系实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用

作者：

王丽;王振东;乔奇;秦艳红;张德胜;田雨婷;王爽;张立军;张振臣

单位：

沈阳农业大学农学院;河南省农业科学院植物保护研究所

关键词：

甘薯褪绿矮化病毒西非株系;荧光探针;实时荧光定量PCR

摘要：

依据Gen Bank中登录的甘薯褪绿矮化病毒(Sweet potato chlorotic stunt virus,SPCSV)西非株系(WA)的核苷酸序列,分别设计两对特异性引物和一条Taq Man探针。以SPCSV-WA外壳蛋白(cp)基因的重组质粒为阳性标准质粒绘制标准曲线,通过优化反应体系和反应条件,建立了SPCSV-WA的实时荧光定量PCR检测方法。试验结果表明,该方法只能检测到目的病毒,标准曲线的斜率和相关系数分别为-3.239和1,扩增效率为103.568%。最低可检测到约3.31 copies/μL的阳性质粒,灵敏度比常规PCR高1 000倍。本研究建立的SPCSV实时荧光定量PCR方法可用于田间样品的检测,为SPCSV的早期预警和流行学研究提供了技术手段。

译名：

Development and application of a real-time PCR method for detection of west African strain of Sweet potato chlorotic stunt virus

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