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转基因烟草中半胱氨酸跨膜基因CYS生物信息学分析

作  者:
罗香怡;高洁铭;刘明慧;曹东;宗渊;刘宝龙;魏乐
单  位:
中科院西北高原生物研究所青海省作物分子育种重点实验室;青海大学农牧学院;青海师范大学生命科学学院
关键词:
烟草(Nicotiana tabacum L.);CYS;基因克隆;生物信息学分析;
摘  要:
在烟草中过量表达MYB转录因子LrAN2,能够激活上调花青素生物合成代谢通路,但富含半胱氨酸跨膜结构域蛋白A (CYS)的表达量明显降低。作为植物中一种重要的生物氨基酸,CYS的生物学研究鲜有报道。本研究克隆烟草的CYS基因,其全长为282 bp,编码氨基酸数94个。预测编码的蛋白分子量和等电点分别为24 019.84 Da和5.23,并且序列中没有保守区。实验结果显示该蛋白具有亲水性,主要由α-螺旋(19.35%)和无规则卷曲(65.59%)构成,CYS蛋白质不通过跨膜区,在膜外进行作用。系统发育树显示,烟草CYS基因与辣椒CYS基因亲缘关系最近,其次是番茄的HTC基因和WIH2基因。本研究结果克隆并分析CYS基因编码区序列,为CYS基因的功能研究提供参考依据。

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