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凡纳滨对虾类泛素折叠修饰蛋白Ufm1基因克隆、序列分析及结构预测

作  者:
盛小伟;高永华;彭金霞;李咏梅;陈晓汉;熊建华
单  位:
广西水产研究所南美白对虾遗传育种中心
关键词:
凡纳滨对虾;差减cDNA文库;Ufm1基因;生物信息学
摘  要:
【目的】了解类泛素折叠修饰蛋白(Ufm1)的结构特征和蛋白功能,为进一步探究Ufm1基因功能提供参考。【方法】以同一生长性状分离凡纳滨对虾家系的肌肉组织为材料,构建凡纳滨对虾生长性状差减cDNA文库,通过斑点杂交筛选获得Ufm1基因,经全长cDNA文库筛选获得Ufm1基因全长序列。【结果】Ufm1基因全长cDNA序列长714bp,包含261bp的开放阅读框,推测编码的蛋白质为86个氨基酸,预测的分子量为9.3ku,等电点pI为6.55;其编码蛋白无信号肽,无跨膜区域,可能定位于细胞质中,属于亲水性蛋白,含有1个酪蛋白激酶II磷酸化位点、1个N-糖基化位点、2个蛋白激酶C磷酸化位点;序列同源性分析表明,不同进化地位物种的Ufm1基因存在较高的同源性。【结论】Ufm1基因在系统进化上高度保守,这为进一步探究Ufm1基因功能及原核表达等奠定了基础。
译  名:
Cloning and sequencing of ubiquitin-fold modifier 1(Ufm1) gene and its structure prediction in Litopenaeus vannamei

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