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Molecular Plant Breeding
2022,20
(1)
49-63
基于转录组测序信息的德国鸢尾MADS-box基因家族分析
作 者：
钱金森;田雅;王飞鉴;赵小杰
单 位：
河北农业大学园林与旅游学院
关键词：
德国鸢尾(Iris germanica);MADS-box;蛋白结构;生物信息学;系统进化树
摘 要：
为探究MADS-box基因家族对德国鸢尾多季花品种花期的影响,本研究基于德国鸢尾(Iris germanica)转录组数据,利用生物信息学方法对MADS-box家族基因进行筛选鉴定,并对其理化性质、功能域及亲/疏水性等方面进行预测分析,且构建德国鸢尾和模式植物拟南芥MADS-box蛋白家族的系统进化树。结果表明,在德国鸢尾中鉴定出39个MADS-box基因家族成员,其编码的氨基酸序列分子量在4 704.58～30 112.19 k D之间,理论等电点(pI)介于5.01～10.92之间,其中32个表现为碱性蛋白,7个表现为酸性蛋白。大多数MADS-box蛋白定位于细胞核和线粒体基质,少许分布在其他细胞器均不含有信号肽。α-螺旋和无规则卷曲为二级结构的主要原件,所有蛋白均表现为亲水性蛋白。进化树分析结果显示,德国鸢尾MADS-box蛋白可聚为5大类(MIKC, Mα, Mβ, Mγ, Mδ)。本研究可为今后进一步研究德国鸢尾MADS-box蛋白的生物学功能提供一定的参考依据。
译 名：
Analysis of the MADS-box Gene Family of Iris germanica based on Information from Transcriptome Sequencing
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