盐胁迫下无瓣海桑差异表达转录因子的转录组信息分析
作 者:
刘婷婷;莫玉剑;欧成川;陈蓓蓓
单 位:
广东海洋大学滨海农业学院
关键词:
无瓣海桑(Sonneratia apetala Buchanan-Hamilton);盐胁迫;转录组测序;差异表达;转录因子;
摘 要:
为揭示转录因子在红树植物无瓣海桑(Sonneratia apetala Buchanan-Hamilton)适应盐胁迫环境中的分子响应机制,本实验以半年生无瓣海桑幼苗为材料,结合三代全长转录本基因集,对正常培养和100 mmol/L NaCl胁迫处理10 d根系样品进行转录组测序分析,并利用实时荧光定量PCR (real time quantitative PCR,RT-qPCR)技术对转录组测序的结果进行了验证。研究发现,共10 867个基因在盐胁迫处理后表达量发生了显著差异(P<0.01, Q<0.05),包括4 180个上调表达与6 687个下调表达基因,其中4 674个基因具备功能注释信息。对注释为转录因子的差异基因进行分析,发现隶属于46个家族的579个转录因子基因在盐胁迫下差异表达,其中上调表达277个,下调表达302个。在这些差异表达转录因子中,包含AP2-EREBP、WRKY、MYB、bHLH、ZFP等已被研究证实的参与调控植物抗盐性的转录因子,暗示转录因子在调节无瓣海桑盐胁迫逆境适应过程中同样可能发挥重要作用。研究结果为下一步深入解析无瓣海桑盐胁迫的分子适应机制提供了理论基础。
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