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Position: Home > Articles > Screening SNPs and Bioinformatic Analysis of Cattle CRP2 Genes Southwest China Journal of Agricultural Sciences 2012,25 (5) 1900-1903

牛CRP2基因SNPs筛查及生物信息学分析

作  者:
杨永强;龚俞;焦仁刚;惠嫣婷;刘若余
单  位:
贵州省畜牧技术推广站;贵州大学动物科学学院
关键词:
CRP2;DNA池;务川黑牛;贵州荷斯坦奶牛;SNPs
摘  要:
为遗传效应分析及CRP2基因对牛生长调控的功能研究奠定基础,选取生长发育性状差异明显的务川黑牛和贵州荷斯坦奶牛构建DNA池,设计1对引物分别扩增2个牛种CRP2基因第6外显子序列和部分3’-UTR(总长724 bp),切胶回收后对PCR产物进行双向测序,进行不同牛种CRP2基因SNPs筛查。结果表明:在CRP2基因有7个SNPs:T20G,C22G,T151C,T285A,T-157C,G-145A,G-85A,包括3个新的SNP位点(C22G,T-157C,G-85A)。CRP2基因第6外显子编码区有2个SNPs,包含1个错义突变(C22G,Gly→Ala)和1个同义突变(T20G);CRP2基因3’-UTR有2个SNPs(T151C和T285A);CRP2基因内含子区有3个SNPs,分别为T-157C、G-145A和G-85A。T20G、C22G和T151C位点等位基因频率在不同牛种间有较大差异。突变前后CRP2的RNA二级结构和蛋白质二级结构有明显改变,蛋白质三级结构无明显差异。
译  名:
Screening SNPs and Bioinformatic Analysis of Cattle CRP2 Genes
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