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Position: Home > Articles > Sequence Analysis and Three-dimensional Structure Modeling of Pyruvate Orthophosphate Dikinase from Echinochloa crusgalli var frumentacea(Roxb.)W.F.Wight Chinese Agricultural Science Bulletin 2007,23 (12) 73-76

家稗丙酮酸磷酸双激酶序列分析及三维结构建模

作  者:
陈卫国;杨进文;王继亮;王金明
单  位:
山西农业大学生命科学学院;山西农业大学农学院
关键词:
序列分析;丙酮酸磷酸双激酶;三维结构同源建模;家稗
摘  要:
【研究目的】目前已从许多种植物中克隆了其PPDK基因,但是对于其蛋白结构的分析尚未报道,此文通过生物信息学方法对家稗PPDK的序列进行了分析,并对其三维结构进行了建模分析;【研究方法】利用DNASTAR、Vector NTI 9、SignalP等生物信息学平台对[Echinochloa crusgalli var frumentacea(Roxb.)W.F.Wight]丙酮酸磷酸双激酶(Pyruvate orthophosphate dikinase)进行了序列分析和三维结构建模;【研究结果】家稗丙酮酸磷酸双激酶(PPDK)同来自于高等植物的PPDK具有较高的同源性,无信号肽,存在17个跨膜结构区,二级结构是由许多螺旋、转角和少量折叠构成。同时在一二级结构分析的基础上,利用同源建模的方法完成了三维结构的建模。【结论】家稗PPDK蛋白同来自高等植物中的更为相近,无信号肽,有17个跨膜结构区,其三维结构为一同源四聚体。
译  名:
Sequence Analysis and Three-dimensional Structure Modeling of Pyruvate Orthophosphate Dikinase from Echinochloa crusgalli var frumentacea(Roxb.)W.F.Wight

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