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甘肃马鹿MyoG基因5′UTR单核苷酸多态性检测及其序列变异分析

作  者:
宋兴超;杨福合;邢秀梅;刘汇涛;岳志刚
单  位:
中国农业科学院特产研究所吉林省特种经济动物分子生物学省部共建实验室
关键词:
甘肃马鹿;肌细胞生成素(MyoG)基因;单核苷酸多态性(SNPs);转录因子
摘  要:
为了初步探索肌细胞生成素(MyoG)基因在鹿科动物上的遗传多态性,试验采集56头甘肃马鹿的血液样品,采用PCR-SSCP和克隆测序的方法对MyoG基因(GenBank登录号:FJ746497)5′UTR部分序列进行了单核苷酸多态性(SNPs)检测及序列变异分析。结果表明:①引物P1的PCR扩增片段存在多态性,经克隆测序分析,在5′UTR-237 bp处存在G→A的转换变异,该位点表现为AA、AB和BB 3种基因型,由A和B 2个等位基因控制;对基因型、等位基因频率及群体遗传多态性分析结果发现,AA基因型频率最高,A基因为优势等位基因,该位点多态信息含量(PIC=0.194)为低度多态(PIC<0.25);经TFSEARCH 1.3分析软件预测发现,该变异可能减少了1个Sp1转录因子。②引物2的PCR扩增片段检测到1个SNP多态位点(—46 bp,G→A),表现为CC、CD和DD 3种基因型,基因型频率分布为CC>CD>DD,该位点多态信息含量(PIC=0.266)为中度多态(0.25
译  名:
Detection of Single Nucleotide Polymorphisms and DNA Sequence Variation Analysis on 5′UTR of MyoG Gene in Gansu Wapiti(Cervus Elaphus Kansuensis)

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