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青海省同德牦牛群体的父系遗传多样性及遗传背景探析

作  者：
李广祯;马志杰;陈生梅;林元;李瑞哲;刘书杰;杨国太;周桑加
单  位：
青海省同德县农牧和水利局;青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室
关键词：
牦牛;Y-SNP;Y-STR;父系遗传多样性;群体遗传结构;起源
摘  要：
[目的]为从分子水平上揭示青海省同德牦牛的父系遗传多样性、群体遗传结构和遗传背景.[方法]本研究对32头同德公牦牛使用5个Y-SNPs标记(SRY4、USP9]Y、UTY19、AMELY3和OFD1 Y10)和1个Y-STR标记(INRA189)进行PCR扩增、测序和分型,使用Bi-oEdit、Arlequin和Network等生物信息学软件综合分析同德牦牛的父系遗传多样性、群体遗传结构及父系起源.[结果]32头同德牦牛5个Y-SNPs标记即SRY4 (969 bp)、USP9Y(470 bp)、UTY19(290 bp)、AMELY3(971 bp)和OFD1Y10(763 bp)的PCR扩增产物测序长度与先前研究结果一致,INRA189标记分型分析共检测到155 bp、157 bp和159 bp 3个等位基因;在同德牦牛群体AMELY3标记中检测到一个新的Y-SNP位点(即g.719 C>T);基于5个Y-SNPs标记11个Y-SNPs位点和INRA189标记3个等位基因的联合分型,共确定了6种Y染色体单倍型(即Y1H1、Y1H2、Y1H3、Y1H4、Y1H5和Y2H6),Y染色体单倍型多样度(Hd)为0.714±0.060,表明同德牦牛具有丰富的父系遗传多样性;系统发育分析显示同德牦牛由2个父系支系组成(即Y1和Y2),提示其拥有2个父系起源.[结论]同德牦牛拥有特殊的父系遗传信息,具有丰富的父系遗传多样性,由2个父系支系组成,拥有2个父系起源.
译  名：
Analysis of Paternal Genetic Diversity and Genetic Background of Tongde Yak Population in Qinghai Provincerovince

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