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'麦缘锦楸'叶色表型qRT-PCR内参基因筛选及验证

作  者:
杨英英;赵林姣;杨桂娟;张玉;付鹏跃;胡继文;刘莹;王楠
单  位:
林木遗传育种国家重点实验室;西南林业大学林学院;三峡大学生物技术研究中心
关键词:
’麦缘锦楸’;叶片;内参基因;qRT-PCR
摘  要:
[目的]筛选不同叶色部位稳定表达的内参基因,为后期开展'麦缘锦楸'叶色形成的分子机制奠定基础.[方法]以'麦缘锦楸'不同叶色部位及灰楸对应部位叶片为材料,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测了7个候选基因(CfUBC、CfActin11、CfPP2A、CfMADH、CfGADPH、CfEF-1及CbuActin)的相对表达量,利用GeNorm、NormFinder和BestKeeper等分析软件对内参基因进行了稳定性评价.分析了'麦缘锦楸'和灰楸不同叶色部位中萜类合成相关基因(CfGES)的表达模式,验证了上述稳定性评价结果的可靠性.[结果]7个候选内参基因在'麦缘锦楸'和灰楸叶片中均具有作为内参基因的性能,其中,CfMADH和CfEF-1在不同叶色部位的表达量最稳定,CfGADPH和CfActin11次之,CfUBC最差.以萜类合成相关基因CfGES验证内参稳定性发现,单独或组合使用CfEF-1及CfMADH为内参基因时,CfGES的表达差异与转录组数据趋势一致.[结论]单独或组合使用CfMADH和CfEF-1来校准'麦缘锦楸'不同叶色部位的基因表达量,可显著提高实验结果的可靠性.
译  名:
Selection and Validation of Reference Genes for Leaf Color Phenotype in 'Maiyuanjinqiu', a Catalpa fargesii Variety, by qRT-PCR
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