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猪传染性胃肠炎病毒疫苗株S基因的克隆及其与流行株的比对分析

作  者:
侯宏艳;潘孝成;尹磊;张丹俊;赵瑞宏;胡晓苗;周学利
单  位:
安徽省农业科学院畜牧兽医研究所安徽省畜禽疫病研究中心畜禽产品安全工程安徽省重点实验室
关键词:
猪传染性胃肠炎病毒;疫苗株;流行株;S基因;遗传变异;
摘  要:
[目的]分析猪传染性胃肠炎病毒(porcine transmissible gastroenteritis virus,TGEV)疫苗株和流行株S基因的遗传变异特征。[方法]利用RT-PCR方法对国内目前广泛使用的TGEV疫苗株A、B、C的S基因进行克隆并测序,将获得的序列与近年来公开发表的分离自不同地区的TGEV毒株S基因序列进行比对分析;选取NCBI中登录号为AF104420.1-Britain、AY587882.1-Nanjing、DQ811786.2-America、EU074218.2-Harbin、FJ755618.2-Harbin、JQ700304-fuzhou、KC609371.1-Shanghai、KX900411.1-United States、M94099.1-Spain和MK272773.1-Fushun的TGEV流行株S基因序列,与疫苗株A、B、C的S基因序列一起,利用MegAlign软件进行比对分析。[结果]疫苗株A、B、C的S基因序列两两间的同源性均在96.7%以上;疫苗株A、B、C的S基因序列与NCBI中流行株S基因序列的同源性分别在94.43%~99.82%、95.30%~99.64%、93.48%~98.38%;由遗传进化树可知,疫苗株A、C与国外流行株M94099.1-Spain在同一分支上,疫苗株B与国内流行株JQ700304-fuzhou在另一分支上。[结论]TGEV疫苗株的S基因与流行株同源性较高,变异性不大。

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