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玉米种子耐储性的全基因组关联分析及候选基因预测

作  者:
孙晓慧;李春翔;刘玲玲;刘杉;韩笑;付畅;周羽;曾兴;王振华;邸宏
单  位:
东北农业大学农学院/教育部寒地粮食作物种质创新与生理生态重点实验室
关键词:
玉米;种子耐储性;关联分析;候选基因
摘  要:
以197份玉米自交系为试材,人工加速老化后进行标准发芽试验,检测种子耐储性相关表型性状,结合平均分布于玉米基因组的SNP标记进行关联分析,挖掘关联SNP位点和候选基因.结果 表明,共检测出8个与相对发芽势(RGE)、相对发芽指数(RGI)、相对活力指数(RVI)和相对简易活力指数(RSVI)等性状呈显著关联的SNP位点(P<0.0001),分布于染色体bin1.08、bin3.08、bin4.03、bin4.05和bin6.05区域;PZE-104063000、PZE-104064763和PZE-106085414这3个SNP位点均与2个性状关联.预测到7个候选基因,分别与纤维素合成酶活性、翻译起始因子、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性、磷酸二酯酶活性、类囊体膜组分、脂肪酸生物合成酰基转运活性和微管有关组分等相关.
译  名:
Genome Wide Association Analysis and Candidate Gene Prediction Related to Seeds Storability Traits on Maize

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