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麝鼠PIK3cb基因的生物信息学分析及表达分析

作  者:
廖光珍;李天峰;张宇;王春阳;史成龙;白素英
单  位:
东北林业大学野生动物与自然保护地学院
关键词:
麝鼠;香腺;PIK3cb基因;生物信息学分析;蛋白表达
摘  要:
为了了解麝鼠PIK3cb基因及其所编码蛋白的性质功能,研究PIK3cb基因在麝鼠香腺周期变化中的作用,试验利用生物信息学分析方法对麝鼠PIK3cb基因编码蛋白的理化性质、跨膜结构、亚细胞定位、磷酸化位点、信号肽、结构域及其高级结构进行了分析,并利用RT-q PCR技术比较了PIK3cb基因在2-9月份麝鼠香腺中的转录水平差异.结果表明:PIK3cb基因的编码序列(CDS)区编码1 070个氨基酸,是不稳定的亲水性蛋白;有76个磷酸化位点;该蛋白的亚细胞定位主要位于细胞质;预测该蛋白由5个结构域组成,即p85蛋白结合域(p85B)、Ras结合域(RBD)、脂质结合域C2(PI3K-C2)、PIK域(PI3Ka)和催化核心域(PI3Kc);在2-9月份的麝鼠香腺中,PIK3cb基因的表达量呈下调趋势.说明该基因在麝鼠的香腺发育或萎缩中可能起到重要调控作用.

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