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蜱携带牛丙型肝炎病毒新亚型巢式PCR检测方法的建立

作  者:
郭銮英;王妮娜;李杭远;纪雨霏;马骏;裴明超;邵建伟;刘全
单  位:
佛山科学技术学院生命科学与工程学院
关键词:
牛丙型肝炎病毒;巢式PCR;蜱;高通量测序
摘  要:
旨在提高新发现的牛丙型肝炎病毒毒株——广东湛江毒株(bovine hepacivirus-GDZJ,BovHepV-GDZJ)的检测及诊断能力,初步了解广东地区蜱携带BovHepV-GDZJ的情况,本研究结合宏转录组学、高通量测序及PCR技术,针对高通量测序结果中丰度高的基因区域,设计该病毒的巢式PCR特异性引物.通过优化巢式PCR方法的最佳退火温度,建立检测BovHepV-GDZJ的特异性巢式PCR检测方法.结果显示:本方法对该病毒标准质粒最低检测值为6.8 copies·μL-1;对沙粒病毒等蜱携带的常见病原均无反应;应用此方法对115份广东湛江的蜱样品进行了检测,测序结果显示,该批蜱携带BovHepV阳性率为46.08%(53/115).本研究首次在蜱中检测到BovHepV,揭示了BovHepV可能的传播途径,并建立了一套针对BovHepV-GDZJ株的特异性巢式PCR检测方法,为广东地区检测和预防BovHepV提供技术帮助,也为控制BovHepV的流行提供参考.
译  名:
The Development of Nested PCR Assay for New Subtype of Bovine Hepacivirus in Ticks

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