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谷子bHLH转录因子家族基因鉴定及生物信息学分析

作  者:
孙颖琦;孟亚轩;赵心月;王凤霞;瓮巧云;赵治海;刘颖慧;袁进成
单  位:
张家口市农业科学院;河北北方学院农林科技学院
关键词:
谷子;bHLH转录因子;蛋白结构;生物信息学分析;
摘  要:
碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)转录因子家族是动植物及微生物中最大的转录家族之一,参与植物生长发育、代谢调控以及应答逆境胁迫。本研究对谷子进行全基因组搜寻,获得bHLH基因家族并研究其理化性质、系统发育、染色体分布、保守结构域以及表达模式。结果表明,从谷子转录组数据库中共鉴定出151个bHLH基因(命名为SibHLH1~SibHLH151),不均匀地分布在9条染色体上,谷子bHLHs蛋白理化性质差异较大,68.9%的bHLH蛋白呈弱酸性。谷子bHLHs蛋白具有两个保守的结构域并含有典型的H 5-E 9-R 13序列。进化树分析显示,151个bHLHs家族蛋白分为18个亚家族,谷子bHLH转录因子与水稻同源性更高,具有更近的亲缘关系。表达分析表明,谷子所有bHLHs转录因子为组成型表达,部分基因受光、温、激素等逆境因子诱导表达。

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