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Plant Quarantine
2022,36
(1)
34-38
进境玉米种子中小麦花叶病毒的检测及其RNA3序列全长扩增分析
作 者:
田沂民;俞禄珍;易建平;王书平;印丽萍;于翠
单 位:
上海海关动植物与食品检验检疫技术中心
关键词:
小麦花叶病毒;进境玉米种子;RT-PCR检测;序列分析;系统发育树
摘 要:
小麦花叶病毒(wheat mosaic virus,WMoV)是严重危害小麦、玉米等禾本科作物的种传病毒,在我国尚无发生,具有重要检疫意义.本研究利用引物WMoV-283F/R全国首次检测出玉米种子中的WMoV,成功扩增出了两个不同典型毒株NP序列,并分析其序列特征.根据WMoV-RNA3、WMoV-RNA3A和WMoV-RNA3B序列特点设计特异性引物,经RT-PCR扩增玉米种子样品2211-2和8044-10的RNA,扩增产物测序得到283 bp基因序列,分别与WMoV分离物GG1-RNA3B(GenBank登录号KT988872.1)、WMoV分离物K1-RNA 3(GenBank登录号KT988889.1)同源性为96.11%、96.47%.设计引物分别扩增玉米种子样品2211-2和8044-10的RNA核衣壳全长序列,得到WMoV-Germany RNA3、WMoV-Malaysia RNA3A和WMoV-Malaysia RNA3B全长序列.使用MEGA6软件采用Maximum likelihood法建立系统发育树,它们分别属于3个同源性差异明显的簇.通过DNAMAN序列比对分析三者的关系,RNA3序列在标尺碱基位点220~506区域序列差异性最大,而序列700~892、972~1102区段则相对保守.这为检测引物的设计提供了重要参考.WMoV的首次截获并鉴定为该病毒的检测鉴定和致病机理研究提供依据.
译 名:
Detection of wheat mosaic virus in imported maize seeds and sequence analysis of its full-length genome of RNA3