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PPP3CA基因多态性与江口萝卜猪肉质性能关联性分析

作  者:
王兴群;毛以智;张继;吴雪;邱淦远;刘鹏程;杨茂林;刘若余
单  位:
遵义职业技术学院;贵州省江口县科技局;贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室;贵州省动物疫病预防控制中心
关键词:
江口萝卜猪;PPPCA;SNPs;肉质性能;关联性分析
摘  要:
钙调磷酸酶(CaN)是调节肌纤维转化的重要信号分子,PPP3CA基因编码CaN催化亚基,对畜禽肉质性能有重要影响.本实验以江口萝卜猪为研究对象,测定了112头江口萝卜猪11项主要肉质性状指标,提取背最长肌中基因组DNA,扩增了PPP3CA基因全部外显子和启动子序列并测序.结果显示:发现3个SNPs位点,分别为A-918C、G154767A和G316451A.启动子上的A-918C位点等位基因分布较均匀,生物信息学分析发现A-918C位点位于一个高评分核心启动子区附近,还会导致2个转录因子结合位点的消失和2个转录因子结合位点的产生,可能会对PPP3CA基因的表达产生影响.与肉质的关联性分析发现,A-918C位点AA和AC型个体肉色明显高于CC型个体,而剪切力反之.双倍型分析发现,H6H7(CC-GG-GA)和H7H7(CC-GG-GG)肉色显著低于其余双倍型,剪切力明显高于其余双倍型,也说明A-918C位点AA和AC型猪肉质优于CC型猪,说明了A-918C位点对肉质性能有明显影响.G154767A和G316451A位点等位基因频率差异大,等位基因分布不均匀,表明群体内变异程度较低.G154767A位点会使mRNA二级结构最小自由能降低,稳定性降低,极显著偏离Hardy-Weinberg平衡.与肉质的关联性分析发现,G316451A位点GG型和GA型大理石纹评分显著高于AA型.本研究结果表明,PPP3CA基因对江口萝卜猪肉质存在明显影响,A-918C和G316451A位点可能是影响江口萝卜猪肉质的重要功能SNPs位点.
译  名:
Correlation Analysis of PPP3CA Gene Polymorphism and Meat Quality Traits in Jiangkou Luobo Pig

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