马龙刚;刘楠;尼玛群宗;王欣;陆健;毛华明;陈功;旦增欧珠;拉巴次仁;张楠;于福清;王雅春

中国农业大学动物科学技术学院;西藏自治区动物疫病预防控制中心;北京奶牛中心;北京交通大学生命科学与生物工程研究院;全国畜牧总站;云南农业大学动物科学技术学院

阿沛甲咂牛;樟木牛;西藏牛;日喀则驼峰牛;SNPs数据;遗传结构;血统组成

旨在探究西藏4个本地牛种的遗传结构和血统组成。本研究以22头高原荷斯坦牛与20头高原娟姗牛以及45头美国婆罗门牛、46头云南瘤牛和11头婆罗门牛为参照标准品种，待测样品为4个西藏本地品种的177头牛。通过Illumina GGP100K芯片杂交获取所有待测个体的SNPs数据，利用MEGA X和Admixture等软件对SNPs进行遗传结构与血统组成分析。结果表明，西藏牛较其他西藏本地牛种与高原荷斯坦牛和高原娟姗牛有更近的遗传关系；部分樟木牛和阿沛甲咂牛将西藏牛分为两个大群；日喀则驼峰牛与云南瘤牛遗传关系更近。在日喀则驼峰牛群体中，高原牛血统比例超过90%,在阿沛甲咂牛与西藏牛群体中，高原牛血统也超过了50%,仅在樟木牛群体中，高原牛血统比例为33.15%。其次，在樟木牛群体中，瘤牛血统占比高达18.27%,在阿沛甲咂牛、西藏牛与日喀则驼峰牛群体中，瘤牛血统较少(5%)。在阿沛甲咂牛群体内有高达35.94%的普通牛血统，在樟木牛群体内，奶牛血统高达48.58%。本研究对西藏本地牛种今后的杂交扩繁和横交固定提供了重要指导作用，也为阿沛甲咂牛与樟木牛两个濒危品种的资源保护和利用提供了理论参考。