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Position: Home > Articles > Isolation,identification and the effect of Saprolegniasison the spleen transcriptome of Schizothorax macropogon Journal of Fisheries of China 2023,47 (8) 133-142

巨须裂腹鱼水霉菌的分离鉴定及其对脾脏转录组的影响

作  者：
孔庆辉;刘海平;刘锁珠;索朗斯珠;徐业芬;赵晓玲;商振达
单  位：
关键词：
巨须裂腹鱼;水霉菌;转录组测序;脾脏组织;差异表达基因
摘  要：
为分析感染水霉菌对巨须裂腹鱼脾脏转录组的影响,探索水霉菌感染巨须裂腹鱼的分子机制,实验随机选取生活在同一水域中的 5 尾健康和 5 尾感染水霉菌的巨须裂腹鱼,采用PDA琼脂培养基和分子生物学方法对巨须裂腹鱼水霉菌进行分离鉴定,并采用Illu-mina HiSeqTM 2000 高通量测序平台,对健康和感染水霉菌的巨须裂腹鱼脾脏组织进行转录组测序,并对测序数据进行拼接、注释和差异表达基因分析.结果显示,从巨须裂腹鱼皮肤上分离鉴定得到 3 株水霉菌;转录组数据显示,健康组和感染水霉病组分别获得46619504 条和 43912876 条数据,与健康组相比,感染水霉菌组共有 1889 个基因发生差异表达,其中 1414 个基因上调,475 个基因下调,随机选取 6 个差异表达基因进行实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证,验证结果与转录组测序一致.对健康组和感染水霉菌组的差异表达基因进行GO功能富集发现,上调基因主要富集于 241 个功能中,下调基因主要富集于 60 个功能中,上述基因主要涉及分子功能类、细胞组分类和生物过程类等生理功能;KEGG通路富集分析发现,差异表达基因主要富集在免疫疾病、内分泌和代谢疾病、病毒感染性疾病、消化系统及排泄系统等.研究表明,感染水霉菌会影响巨须裂腹鱼脾脏组织多种基因的表达量,实验结果为进一步探索巨须裂腹鱼水霉菌的感染机制奠定了基础.
译  名：
Isolation,identification and the effect of Saprolegniasison the spleen transcriptome of Schizothorax macropogon
关键词：
Schizothorax macropogon%Saprolegniasis%RNA-Seq%spleen tissue%differentially expressed genes

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