作 者：
布尔兰·叶尔肯别克;孙莉莉;安外尔·约麦尔阿卜拉;郭文佳
关键词：
骨膜蛋白;乳腺癌;单细胞测序;免疫检查点;药物敏感性
摘 要：
利用单细胞RNA测序（single-cell RNA-seq,sc RNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，探讨骨膜蛋白（periostin,POSTN）在雌激素受体阳性（estrogen receptor positive,ER+）乳腺癌中的表达特征及其临床相关性，为ER+乳腺癌患者的诊断、预后和个体化治疗提供理论建议。利用基因表达总库（gene expression omnibus,GEO）中的sc RNA-seq数据鉴定ER+乳腺癌的细胞亚群和POSTN的表达特征。通过细胞轨迹和细胞通讯进一步分析POSTN和特异性高表达POSTN的癌症相关成纤维细胞（cancer-associated fibroblasts,CAFs）亚型。利用癌症基因组图谱（the cancer genome atlas,TCGA）数据库中的ER+乳腺癌数据，分析POSTN的表达水平、诊断和预后价值、通路富集、免疫治疗反应和药物敏感性。基于ER+乳腺癌的sc RNA-seq数据，鉴定出一组高表达POSTN的CAFs，命名为POSTN+CAFs。它们都处于分化的晚期阶段并对细胞间通讯至关重要；基于ER+乳腺癌bulk RNA-seq数据，发现POSTN在ER+乳腺癌中显著表达，并且与诊断和预后有相关性；根据功能富集分析，POSTN可能在血管生成、转移以及癌症的发生和进展中发挥作用；POSTN表达水平较低的个体可能从免疫治疗中获益；化疗药物对POSTN低表达的患者影响更大。基于sc RNA-seq和bulk RNA-seq，全面分析了POSTN和POSTN+CAFs在ER+乳腺癌中的生物学作用，并得出结论，POSTN可能是ER+乳腺癌诊断、预后、治疗反应和治疗靶点的生物标志物。
译 名：
Comprehensive Analysis of POSTN in ER+Breast Cancer——Based on Single-cell RNA and Bulk RNA-seq Sequencing
