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当前位置: 首页 > 文章 > 千穗谷TCP基因家族生物信息学分析 草地学报 2022 (3)
Position: Home > Articles > 千穗谷TCP基因家族生物信息学分析 Acta Agrestia Sinica 2022 (3)

千穗谷TCP基因家族生物信息学分析

作  者：
周涛;彭辉;喻望晨;刘宁芳;胡龙兴;徐倩
单  位：
湖南农业大学农学院草业科学系
关键词：
千穗谷;TCP;转录因子;miR319;基因家族;
摘  要：
TCP是一类与植物生长发育密切相关的转录因子。基于最新发布的千穗谷基因组，本研究鉴定出16个TCP家族基因，并根据序列特征和结构域特点将其分为ClassⅠ和ClassⅡ两个亚类，其中ClassⅡ亚类又可分为CIN/TB1和CYC两个分支。染色体定位结果显示，千穗谷TCP家族成员不均匀地分布在6条染色体上，个别基因呈簇状分布。根据phytozome数据库信息可知，千穗谷TCP家族不同基因在各个组织中的表达模式不同，且与所属亚类相关。此外，顺式作用元件分析结果显示，AhTCP基因启动子中包含大量与生长发育、激素信号和逆境胁迫相关的元件，且不同成员所含元件的数目和类型与其直系同源基因相似。已知TCP基因是miR319的主要靶基因，根据结合位点预测发现千穗谷中CIN分支的3个成员编码区均存在miR319的作用位点。本研究为千穗谷TCP转录因子家族的功能和调控机制研究提供了理论基础。

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