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低海拔与高海拔斑头雁肺脏的比较转录组学分析

作  者:
候建平;郑思思;朱丽琳;赵文信;何顺福;王稳
单  位:
青海大学省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室;西宁市野生动物疫源疫病监测站
关键词:
斑头雁;肺脏;转录组;低海拔;高海拔
摘  要:
为探究高低海拔斑头雁肺脏差异表达基因和差异代谢通路的变化,基于Illumina NovaSeq 6000测序平台对斑头雁肺脏组织进行转录组测序,分析差异表达基因,利用荧光定量PCR对部分差异表达基因进行验证,进一步对差异表达基因进行GO功能富集分析和KEGG信号通路富集分析.结果:与高海拔组斑头雁肺脏相比,筛选出差异表达基因84个,其中上调差异表达基因51个,下调差异表达基因33个.经GO功能注释后富集到21个显著性GO功能,"生物过程"显著富集到11个条目,涉及代谢过程以及内源性刺激的应答等."细胞组成"显著富集到1个条目,涉及到细胞外区域."分子功能"显著富集到9个条目,涉及到酶活性、激素、转录因子、钠离子跨膜转运等.注释到KEGG的显著性富集通路有3条,涉及到糖胺聚糖降解通路、丝裂原活化蛋白激酶信号通路以及丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢通路.本研究结果丰富了斑头雁的基因资源,为该物种海拔适应相关基因的功能研究奠定了基础.
译  名:
Comparative transcriptome analysis of the lung of low-altitude bar-headed geese and that of high-altitude ones

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