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牛Bcl-2基因生物信息学功能预测分析

作  者:
丁嘉怡;郭慧玲;罗一鸣;康文林;李康;李谷月
单  位:
江西农业大学动物科学技术学院
关键词:
牛;Bcl-2基因;Bcl-2蛋白;蛋白质分析;生物信息学;
摘  要:
为了预测Bcl-2基因生物学功能在细胞凋亡和自噬交叉性调节中发挥的作用,试验采用BioEdit软件、NCBI、ExPASy-ProtParam tool、TMHMM Server v.2.0、SPLIT 4.0、SignalP 4.1 Server、PSORTⅡ、PSIpred-MEMSAT 3、SWISS–MODEL生物信息学分析手段,对牛Bcl-2基因及编码蛋白质的结构和特征进行预测分析。结果表明:牛Bcl-2基因可编码229个氨基酸残基,构成可溶酸性亲水性蛋白质,蛋白质公式为C1 132H1 717N311O316S9,原子总数为3 485,理论等电点为6.65;半衰期为30 h;不稳定性指数为58.20;分类为不稳定蛋白;脂肪指数为76.77;亲水性的平均值(GRAVY)为-0.133,预测Bcl-2蛋白为亲水蛋白;含有跨膜区且不存在信号肽,为非分泌跨膜蛋白;分布于细胞质、核、内质网、高尔基体、线粒体、分泌系统的囊泡、细胞骨架及液泡中;主要由51.53%的α-螺旋、6.99%的β-转角、6.55%的延伸链与34.93%的无规卷曲组成,其三级结构预测结果与二级结构预测结果基本一致。说明牛的Bcl-2基因在哺乳动物中具有高度保守性,Bcl-2蛋白主要分布在细胞膜结构上,为酸性亲水跨膜结构蛋白,C端具有疏水结构区,与调节细胞凋亡功能有重要关联。

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