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玉米野生近缘种大刍草幼苗叶片的转录组SSR分析

作  者:
刘强;赵丽;郭虹霞;张丽光;邓妍;王陆军;王创云
单  位:
山西大学生物工程学院
关键词:
玉米;大刍草;转录组;SSR;分子标记
摘  要:
通过对大刍草转录组测序来发掘SSR标记位点,结果发现14 099个SSR位点,出现频率为13.31%.三核苷酸和单核苷酸是主要重复类型,分别占SSR总数的42.12%和25.65%;六核苷酸重复所占比例最小,占0.43%.转录组结果表明,大刍草SSR中共发现38种重复基元,单核苷酸重复基元A/T出现频率最高,占总SSR的21.06%;其次为AG/CT和GCC/GGC,分别占6.759%和5.53%.5次重复的SSR数量最多,有3 927个,占总SSR的27.85%.研究结果为大刍草的SSR分子标记研究、遗传多样性分析、种群遗传结构等提供基础.

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