基于微卫星标记评估凡纳滨对虾收获体长、体质量以及抗WSSV性状的遗传参数
上海海洋大学;青岛海洋科学与技术试点国家实验室
- 摘 要：
- 为更加准确地评估凡纳滨对虾体长、体质量以及抗WSSV性状的遗传参数,实验利用8个微卫星位点对凡纳滨对虾69个家系母本和子代进行基因分型,并利用分型信息进行系谱重构和分子亲缘关系相关度的计算,以重构系谱、分子亲缘关系度以及物理系谱分别构建加性遗传相关矩阵,进而对体长、体质量和抗WSSV性状的遗传参数进行评估.最终通过交叉验证的方法,比较三者对遗传参数评估的预测能力以及准确性.分型结果显示,8个微卫星位点,共检测到166个等位基因,各位点等位基因数为12~45个,亲本和子代群体每个位点平均等位基因数分别为9.50个和18.13个,平均观测杂合度分别为0.618和0.709,平均期望杂合度分别为0.749和0.775,平均多态性信息含量分别为0.711和0.750,所有位点均表现高度多态性.遗传力分析结果显示,利用物理系谱、重构系谱以及分子亲缘相关度对体长的遗传力估计值分别为0.119±0.031、0.120±0.032、0.132±0.030,对体质量的遗传力估计值分别为0.176±0.039、0.182±0.040、0.172±0.034,对抗WSSV性状的遗传力估计值分别为0.135±0.033、0.134±0.033、0.098±0.031,在体长、体质量以及抗WSSV性状的遗传力中,以分子亲缘相关度评估的标准差小于重构系谱和物理系谱.通过交叉验证,三者对遗传参数评估的预测能力以及准确性从高到低分别为分子亲缘相关度、重构系谱、物理系谱.研究表明,利用微卫星分子标记评估凡纳滨对虾体长、体质量以及抗WSSV性状遗传参数比利用物理系谱评估具有更高的准确性,但同样利用微卫星分子标记进行遗传评估,直接利用子代的亲缘相关度比重构系谱具有更好的效果.本研究为凡纳滨对虾遗传参数的评估提供了更为精确的方法,为进一步良种选育提供了参考资料.
关键词：凡纳滨对虾;微卫星;分子亲缘关系;系谱重构;遗传力
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