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基于高通量测序Survey评估测定雷竹基因组大小

江西省林业科学院

摘  要:
为研究雷竹基因组信息,基于高通量测序,利用Illumina测序平台对雷竹基因组进行了分析,采用K-mer法预测雷竹基因组大、杂合度和重复序列等基因组特征,结果表明:雷竹基因组大小约为1 913 Mb,修正后为1 897 Mb,杂合率为1.7%,重复序列比例为69.38%。

关键词:雷竹;高通量测序;K-mer分析;基因组大小;杂合度;

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所属期刊

竹子学报

ISSN: 1000-6567

CN: 33-1399/S

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