高粱GATA转录因子家族的鉴定和表达模式分析
贵州省农业科学院旱粮作物研究所;贵州大学农学院
- 摘 要:
- GATA基因家族是真核生物中的一种转录因子,在动植物发育分化、生长增殖、分解凋亡以及植物响应环境变换等生物学过程中发挥着重要作用。本研究利用生物信息学手段对高粱(Sorghum) GATA基因家族进行了全基因组分析,鉴定得到31个GATA基因家族成员,定位在9条染色体上(第7号染色体除外);亚细胞定位预测表明这些基因主要位于细胞核上;系统进化分析可将高粱GATA成员分为3个亚家族,大部分相似功能的已知植物GATA成员被聚在同一分枝上;表达模式分析表明,21个高粱GATA家族成员在6个高粱组织中表达具有特异性。本研究鉴定并分析了高粱GATA转录因子的生物学信息特征,为分子水平上高粱GATA家族基因的功能研究提供了一定的理论基础。
关键词:高粱;GATA基因家族;转录因子;基因表达分析;
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