马尾松树高生长性状显著关联基因挖掘
广西壮族自治区林业科学研究院广西优良用材林资源培育重点实验室国家林业和草原局马尾松工程技术研究中心广西马尾松工程技术研究中心
- 摘 要：
- 全基因组关联分析是获得控制目标性状基因的重要方法。为挖掘马尾松（Pinus massoniana）树高生长性状所在基因序列并了解其基本功能，通过对9个SSR标记的转录组序列进行第2代测序与第3代全长转录组测序，将两者结果进行比对，获得9个位点所在基因的全长转录组序列，并在七大数据库进行基因功能注释。结果表明，9个基因的第2代测序结果与第3代全长转录组测序结果比对一致性平均为99.69%，均具有高度的一致性。经第3代全长转录组测序，9个基因序列平均长度为1 706 bp，比第2代测序结果稍短。经过数据库比对，经第3代全长转录组测序，9个基因分别在云杉（Picea asperata）、白云杉（Picea glauca）和油松（Picea tabuliformis）基因组中发现同源基因。8个基因在数据库中获得功能注释，分别属于转录因子、电子传递链参与基因、60S核糖体蛋白大亚基编码基因、ATP酶类编码基因及TCHQD类谷胱甘肽S-转移酶编码基因。研究结论可为马尾松树高生长分子调控机制研究提供重要参考。
关键词：基因组测序;树高;马尾松;
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