水稻'宜香优2115'OsZIP3基因的克隆及序列分析
凯里学院大健康学院;凯里学院数学科学学院
- 摘 要：
- 植物ZIP （Zn-regulated transporter, Iron-regulated transporter-like protein）家族蛋白是负责吸收、转运和分配Zn和Fe等离子的完整膜转运蛋白,对维持植物体内Zn和Fe平衡起关键作用,ZIP家族的成员之一Os ZIP3参与Zn分配,OsZIP3是水稻锌高效相关的备选基因。为了明确OsZIP3基因在富锌水稻品种中的分子特征,本研究利用RT-PCR技术从‘宜香优2115’中克隆到ZIP3基因,命名为OsZIP3-YXY2115,并对其进行生物信息学分析。序列分析结果表明,该基因的编码区（CDS）全长为1 095 bp,编码364个氨基酸,蛋白序列含有6个跨膜结构,蛋白分子量38.0 kD,理论等电点8.67,不稳定指数42.34,为不稳定蛋白。结构域预测结果显示Os ZIP3-YXY2115蛋白含有ZIP家族锌铁转运系列结构域,属于锌铁转运蛋白（ZRT/IRT-like protein, ZIP）家族成员。亚细胞定位预测分析表明,Os ZIP3-YXY2115蛋白定位于细胞质膜中。氨基酸序列比对结果表明,其与已报道的粳稻OsZIP3 （XP015635611.1）相似性最高。该研究结果为进一步分析ZIP3基因功能及作物富锌育种提供了一定的理论基础和基因资源。
关键词：水稻（Oryza sativa L.）;锌;OsZIP3基因;序列分析;
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