枸杞果胶酯酶基因LbPME克隆及表达分析
宁夏农林科学院枸杞科学研究所/国家枸杞工程技术研究中心;宁夏农林科学院荒漠化治理研究所
- 摘 要:
- 以宁夏枸杞(Lycium barbarum L.)'宁杞1号'果实为材料,利用RT-PCR技术,克隆出LbPME的全长序列为1152 bp,包含完整的开放阅读框(ORF),编码有384个氨基酸,蛋白质分子量为42.63 ku,理论等电点9.20;LbPME编码的蛋白包含2个可能的N-糖基化结合位点(Asn46和Asn183),4个底物结合位点(Thr166、Gln201、Arg301和Trp303)和2个酶活性位点(Asp224和Asp245).分析发现,该蛋白由多个呈右手螺旋的β折叠肽链组成,且含有1个中空三角柱状的PME经典结构;LbPME与茄科的烟草的同源性达到90.86%.利用实时荧光定量技术,发现不同组织中Lb PME均有表达,且在茎中最高而叶中最低,两者存在显著差异;随着果实的发育,Lb PME表达量呈现出先升后降趋势,在青果期表达量最高,随后显著降低,在成熟期维持较低水平.本研究结果为进一步探讨枸杞Lb PME的功能奠定了基础.
关键词:枸杞;果胶酯酶基因;克隆;表达
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