海南普通野生稻NBS类抗病基因同源序列的分离与分析
海南省农业科学院粮食作物研究所
- 摘 要:
- 为研究海南普通野生稻中的STK类抗病基因,根据已知植物抗病基因NBS(Nucleotide binding site)序列中的保守区域设计简并引物,以海南普通野生稻基因组DNA为模板扩增得到4条具有连续ORF的抗病基因类似物(Resistance gene analogues,RGAs)序列,它们核苷酸序列间的相似性系数在53.14%-99.81%之间,而相应推测的氨基酸序列间的相似性系数在39.08%-99.42%之间。对氨基酸序列进行结构分析表明,它们包括"P-loop""、Kinase-2a""、Kinase-3a"和"GLPL"4个抗病基因所共有的保守模体,并且4条海南普通野生稻NBS-LRR类似物均属于nonTIR-NBS类抗病基因片段。
关键词:普通野生稻;抗病基因类似物;基因分离;序列分析
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