基于ITS序列分析对海南普通野生稻籼粳分化的研究
海南大学农学院;中国农业科学院生物技术研究所
- 摘 要：
- 对海南普通野生稻的18个居群分别进行ITS序列克隆和测序,研究海南普通野生稻居群的籼粳分化。结果表明,海南普通野生稻的ITS序列居群间差异性显著,ITS1长度为163～239bp,G+C含量变化范围为53.5%～77.2%。ITS2长度为165～243bp,G+C含量变化范围为54.5%～74.2%。ITS1和ITS2区简约信息位点分别为108个和145个,单一信息位点分别为7个和2个。InDel(插入/缺失)位点分别为133个和145个,发现了9个ITS籼粳特异性位点。ClustalX软件排序及Mega构树结果表明,海南普通野生稻存在籼粳分化,偏籼型有10个居群,偏粳型有8个居群。本研究有助于揭示海南普通野生稻在起源演化上的地位,并为有效利用海南优良野生稻种质资源提供理论依据。
关键词：普通野生稻;ITS序列;籼粳分化;海南
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